非细菌性前列腺炎须与其他特异性前列腺炎尤其是慢性细菌性前列腺炎相鉴别。有时在鉴别诊断中还应考虑尿道炎和膀胱炎。在有刺激性排尿症状和细菌培养阴性的中老年男性患者中 还应仔细地分析是否有膀胱肿瘤，特别是膀胱癌的存在，这时除作尿细胞学检查外 还须作膀胱镜检查。