现在就是测量方法的另一个重点了:count/size

1.选择测量项目

在count/size窗口的measure菜单项下点select measurements,调出这个选择测量项目的窗口。左边列出了所有可供选择的测量项目,中间是已经选择的测量项目,area是默认选择的,一般都需要测量,其他的只要在左边框里的项目上点一下就能选择上,再点一下就能取消掉。
中间是filter ranges,对于每一个测量项目,可以通过限定其取值范围来进一步精确地选择测量区域。
以面积测量为例,实际上你选择某种颜色时不仅会选择上需要的区域,还可能会选择上大量微小的杂质点。在此你可以只选择面积大于一定数值的区域来测量。
在filter ranges框里点一下area,再到下面的start 与end项下填上一个范围值。默认的值是10到最大,你完全可以把它们限制在100到5000这样的数值范围内。
右边是每个测量项目的说明,例如你点了perimeter这个测量项目,就能在这里了解一下这是测量的什么具体指标。
也许你没太注意,现在你可以一次测量非常多的指标。
2.选择测量环境

在count/size窗口里点右下方的option按纽,调出这个option窗口。这里设置了一些测量环境。
上面是关于显示的项目,就是如何显示被测量到的那些区域(class),
choose color可以选择用什么标记色来标记测量到的区域。这与前面segmentation中的标记色不同,被segmentation标记上的地方未必就一定会被测量,它可能会被过滤掉的。所以经过过滤后,选色时的大片小杂质点在测量后却看不见了。
outline style: 可以不标记(nine),也可以显示为外框(outline),或者填充上标记色(filled).
Label Style:这是选择给测量的区域作字符标记的,不仅可以标记编号,也可以标记上测量的数值。字符颜色由下一行来选择,不过,如果图片上的色块又多又小的时候,还是选择none比较好。
Object Options:
4-connect 的意思是,两个区域若有四个象素以上的相连,它们就算作是一个区域。
Smoothing: 这是平滑边界,选个大于零的值,测量区域会显得好看一点。不妨选择1或2,不能太大了,太大会差得过多。
Filled Holes:是否填充一个区域里的空洞?这可得看准了选。如果填充了,空洞是会被当作选择区域来参与测量的。
Clean borders :这是考虑要不要测量图片四边的区域?这些区域可能被图片边界削掉了一半,测量时是否测量它们就有讲究了。
3.选择测量区域。
方法一:点select color按纽,这是用选择颜色范围的方法来选择测量区域。调出来的就是segmentation工具。
方法二:点程序工具栏上的AOI按纽,就是那几个方形,园形及irregular工具,在图片上手工选择一个或几个区域。然后到count/size窗口中点菜单edit下的 convert AOIs to objects.

方法三:上面两个方法联合使用,其效果是,先会选择一个AOI区域,然后在这个区域内用segmentation工具选择颜色。最后会测量AOI区域内选择的颜色。看下方的例子:用irregular工具先画一个区域,(这时候不能点convert to object)然后用segmentation选择红色的色块。测量后,绿线圈内的红色块被测量了,外面的两个红色块就不管了。

4.图象背景较正。
很多显微镜照相机包括CCD相机都有个缺点,就是拍摄的图片中间亮四周暗。一般我们注意不到,但是,一旦需要作光密度分析或者照片较暗的时候,这种背景影响就显著了。校正背景也是所有软件包括IPP的一个重要功能。不太严重的背景亮度不匀,用count/size中Image菜单下flaten background工具就能搞定。
下面这张图片,右边是原图,看上去亮度很均匀,但把图片亮度降低就能看到四周先变成黑色,而中间依然还有亮。

在调出的flatten窗口中,要指定一下是亮背景还是暗背景,最重要的是那个max feature size数值,要选择为照片边长的四分之一左右。一般的一百万像素的照片,边长在一千左右,我喜欢选择200或300。当然,最终要看效果,既能平滑背景亮度,也能保持照片细节不被改变。

这张照片长边是720象素,用200来平滑背景后,效果很好。背景亮度相当均匀。
平滑背景亮度对显微镜照片有很重要的意义,利用IPP还有更准确的方法来平滑背景亮度。
5.保存测量项目参数
如果要测量多张照片,就需要使用相同的条件去测量,也不能每测量一张照片都这么一下一下地点菜单呀。所以要保存测量条件。

上图中,save settings 是保存测量条件,save outlines是保存选择区域轮廓。前一个是必须保存的。后一个在一些测量中有特殊的用处。相对应的,还有load settings,这是调用保存的条件文件。
另外,选择颜色的文件也要保存的。在segmentation工具窗口的下方也有个file按纽,进去后也有save 和load两个按纽命令。
5.测量。
这个简单。
当使用irregular工具选择了测量区域,在点了convert AOI to object 之时,就把数据给测量了。
当使用segmentation作了选色后,要点击 count按纽进行测量。
所以,要记住,先设置好各项测量参数环境,然后再选色,测量。
测量之后,被测量到的区域会加上标记色或者标记字符。
6.提取测量数据

在count/size窗口的view菜单下是各种数据显示的子菜单,最常用的是statistics与measurement data.
如果图片上色块很多,测量数值会非常庞大的。此时需要使用DDL功能把数据送到别的地方。

先要设置一下DDE,一般情况下,送到excel里最方便,还要指明一下其程序位置。特别是excel被安装到D盘的时候,往往会找不到。
最主要的是下面的表格位置,数据放在第几行,第几列。一般是两种选择,一是每次都放在同一个位置,下一张照片还放在这里。这就要求每处理一张照片后要立即处理传出来的数据。否则就是下一个数据覆盖掉了。另一个选择是把数据追加到前一组数据的后面。
然后,点DDE to excel就能送出数据了。如果桌面上有已经打开的excel表格,就直接送过去,否则就建立一个新的excel表格,并把数据送入。
IPP5与IPP6在这个操作步骤上略有不同。

