药物设计
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2008-08-04 22:29
在CoMFA里也涉及F检验。很少人利用这个F检验。
F检验临界值表的F值表达为:F(α,numdf,denomdf)   #注意其中的顺序,查询时要注意。
涉及三个下标:α, 分子自由度,分母自由度。
每个表格对应不一样的α,也就是p=0.1, 0.05,0.025,0.01等,所谓的显著性水平了。
一般情况下,列为分子自由度,行为分母自由度,而且会在表格上注明,注意不要搞错,否则天差地别。查询的时候,注意区分就是。
典型的一个临界值表格如下:
来自:http://www.medcalc.be/manual/f-table.php
 
2008-07-13 19:54
在SYBYL8.0的手册中,终于以书面的形式告诉用户CoMFA对数据的要求:

2.5.2 Prequalifying your data

Experimental Data

    Your experimental data should possess two properties:
    • It should cover a range of at least 2-3 orders of magnitude
    • It should be evenly distributed over this range
    First make sure you are working on a log scale. If your experimental data is a concentratio
 
2008-07-13 18:39
网址:http://www.dockingserver.com
可以在线提交autodock任务,免费。
如果有偿使用,会得到更好的服务。
dockingServer is an internet service that calculates the site, geometry and energy of small molecules interacting with proteins. You can dock your ligands to your proteins (see Flexible ligand docking) and analyze their interaction in 5 easy steps. The DockingServer is offered to everyone in the field of
 
2008-07-08 08:12
名称:Semagacestat
作用类别:gamma-secretase 抑制剂。
适应症:
阿尔茨海默氏病(Alzheimer’s Disease,AD)
研究进度:临床III期
结构式:
 
2008-06-30 08:46
http://www.chemspider.com
       为做化学工作的人免费提供了很多理论与实验数据。包括光谱,熔点,沸点等物理性质。各商业、学术数据库对该化合物的收载情况等。
       对于药化或药物设计的人来说,依据靶点检索化合物也是很有用的功能。
      
引用一下其它公司对它的评价吧:
ChemZoo, Inc., was founded with the intention of providing online chemistry software and services to help build a chemic
 
2008-06-23 14:57
什么是designer drug?
将禁药列表中的药物结构改造,以避开法律但保留禁药效果,即称为designer drug.
http://en.wikipedia.org/wiki/Designer_drug
里面列出了著名的designer drug
我只是告诉大家,做外贸订单一定要小心,不要参与。
 
2008-06-23 14:13
之前,有许多人问我,我是怎么做的。
1)drugs of the feature 是个很不错的杂志

2)其它的各种杂志或在线数据库
   比如pharmaprojects: http://www.pjbpubs.com/pharmaprojects/index.htm
          汤姆森医药科技: http://www.thomsonscientific.com.cn
   等等,这些都是很昂贵的资源。

3)我主要强调的是,如何自己获得,其实不过一个苦力活:
   A,到各国或地区的药品审评或监管机构的网站上查询;
 
2008-06-23 13:55
除了网络上常见的国外的全文数据库外,国内的数据库或全文提供的服务也是不错的。
1)国家科技文献检索中心
   网址: www.nstl.gov.cn
   预付费后,对方可以给您以电邮以及邮寄的方式,基本上在第二天可以得到文献,如果他们那有的话。
   中外的文献,博士硕士论文都可以得到。
   大部分的文献在这里都可以得到
   支持网银支付,可以开发票

2)CNKI
    www.cnki.net
   这个大家比较了解
 
2008-06-06 14:39

研究阶段:成人慢性特发性血小板减少性紫癜待批,丙型肝炎患者的血小板减少症治疗处于PIII

Thrombopoietin (TPO) is a g

 
2008-06-03 11:55
Tools to build molecular-docking activity prediction models by PLS regression with iterative training and pose-selection. Descriptors include (i) docking score(s), (ii) pharmacophore features, (iii) multi-feature descriptors learned by decision trees.


介绍及下载:
http://sourceforge.net/projects/autoshim
http://www.daylight.com/download/contrib/autoshim.html

AutoShim是一种用PLS回归建立分子对接活性预测模型的工具。描述符包括:1)对接打分;2)药效团特征;3)决策树学
 
     
 
 
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