1187年，萨拉丁集结力量进攻十字军中最强的耶路撒冷王国。7月3日，萨拉丁在太巴列湖西岸附近的赫淀包围了十字军。阿拉伯军队点燃十字军营地周围的灌木丛，浓烟熏得十字军喘不过气来。十字军没有水喝，极度干渴。太巴列湖虽近在咫尺，但是他们却无法冲破阿拉伯军队的包围。在盛夏的酷热中，大批十字军战士渴死和热死。

        4日清晨，十字军将领雷蒙率领骑士发起冲锋，萨拉丁命令军队留出一条缝隙，让他们逃走，然后再合围，将全部耶路撒冷步兵包围起来。最后，耶路撒冷的十字军几乎被全歼。

        耶路撒冷王国已经无力抵挡萨拉丁。经过13天的围攻，耶路撒冷投降。萨拉丁选在登霄节这一天进入耶路撒冷，以纪念先知穆罕默德在耶路撒冷登霄。

        与88年前十字军攻克耶路撒冷时大开杀戒形成鲜明的对比，萨拉丁进入耶路撒冷没有杀一个人，没有烧一栋房子。根据受降时签订的协议，耶路撒冷每个男人要缴纳10第纳尔赎金，每个女人缴纳5第纳尔，儿童1第纳尔；无力缴纳的人则成为奴隶。萨拉丁免去了7000穷人的赎金。萨拉丁的弟弟向萨拉丁要了1000名奴隶，随即将他们释放。耶路撒冷主教也随即效仿，向他要了700名奴隶然后释放。最后，萨拉丁自己宣布释放了所有战俘，不要一分赎金。

        在十字军占领期间，阿克萨清真寺被改为圣殿骑士团的总部，磐石清真寺成了教堂。萨拉丁将它们恢复为清真寺。磐石清真寺金顶上的十字架被拆除，宣礼的声音再次回荡在阿克萨清真寺的上空。有人向他建议拆毁耶路撒冷的圣墓大教堂，萨拉丁没有同意。相反，他将耶路撒冷的圣地向所有宗教开放。
    萨拉丁占领耶路撒冷的消息震动了欧洲。教皇乌尔班三世闻讯后惊愕得心脏停止了跳动。继任教皇格利高里八世呼吁采取行动。十字军的热情再次被激发起来，德意志皇帝“红胡子”弗里德里希、英格兰国王“狮心王”理查、法兰西国王菲利普发动了第三次十字军东征。

        十字军将主攻目标选在阿卡。1191年6月，理查抵达阿卡。对阿卡的围攻已经持续了两年。十字军建造了3座巨大的移动攻城塔，用抛石机攻城。从贝鲁特赶来的穆斯林支援舰队被理查的大帆船击沉。7月12日，阿卡守军投降。由于俘虏交不出20万金币的赎金，理查命令将2700名战俘全部斩首。

        向耶路撒冷进军非常困难，理查曾经发誓在征服耶路撒冷之前绝不看它一眼。一次他偶然在山丘上看到了圣城的城墙，只好用盾牌遮住脸，以免背誓。1192年，双方在雅法大战，不分胜负。战场上，理查的马摔倒在地，具有骑士风度的萨拉丁让弟弟阿迪勒给他送去两匹好马。

        大战之后，萨拉丁和理查都病倒了。萨拉丁派人给自己的死对头理查送去了水果，还派去了医生。双方签订和约，穆斯林占有巴勒斯坦内地，基督教徒占有海岸，耶路撒冷向朝觐的基督教徒开放。理查随即离开巴勒斯坦回国。